Les Molunes est une commune française, située dans le département du Jura et la région Franche-Comté. C'est une commune de montagne, sise dans le Parc naturel régional du Haut-Jura et dans le Massif du Jura. Elle est née en 1793 du démembrement de la communauté de Septmoncel. Sa mairie est, à 1270m d'altitude, la plus haute de Franche-Comté.